Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab11bP46638 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rab11bP46638 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rab11bP46638 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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