Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms