Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja4P28235 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja4P28235 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja4P28235 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms