Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afxP27661 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms