Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms