Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a1P19437 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a1P19437 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms