Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01665 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01665 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01665 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01665 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01665 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01665 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01665 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01665 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01665 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01665 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01665 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01665 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01665 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01665 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms