Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syngr2O55101 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syngr2O55101 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms