Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp100O35892 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp100O35892 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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