Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prrt1O35449 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prrt1O35449 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prrt1O35449 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prrt1O35449 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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