Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pld3O35405 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms