Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra2O08842 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra2O08842 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms