Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms