Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt78E9Q0F0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms