Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms