Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6133B2RY53 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms