Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms