Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ybx3Q9JKB3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms