Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPJQ9HC77 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPJQ9HC77 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms