Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn2Q9ER65 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms