Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms