Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm5Q9D6G9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms