Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rfc5Q9D0F6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rfc5Q9D0F6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rfc5Q9D0F6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rfc5Q9D0F6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfc5Q9D0F6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms