Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmtm8Q9CZR4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmtm8Q9CZR4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms