Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx7Q9CY18 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms