Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms