Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxp3Q99JB6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms