Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CsprsQ99388 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CsprsQ99388 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms