Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim7Q923T7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms