Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncbQ91ZZ3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncbQ91ZZ3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms