Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Trim68Q8K243 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Trim68Q8K243 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Trim68Q8K243 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Trim68Q8K243 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim68Q8K243 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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