Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8C5C9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms