Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms