Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trim35Q8C006 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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