Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms