Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms