Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga6Q61739 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms