Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp28Q5I043 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp28Q5I043 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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