Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms