Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms