Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms