Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms