Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Apoc2Q05020 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Apoc2Q05020 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Apoc2Q05020 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoc2Q05020 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms