Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Runx1Q03347 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms