Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms