Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd13P70217 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms