Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxna3P70208 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxna3P70208 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms