Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tuba4aP68368 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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