Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufm1P61961 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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