Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad23aP54726 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms